Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EPHA1P21709 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EPHA1P21709 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms