Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACO1P21399 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACO1P21399 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACO1P21399 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACO1P21399 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACO1P21399 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACO1P21399 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACO1P21399 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACO1P21399 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACO1P21399 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACO1P21399 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACO1P21399 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACO1P21399 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACO1P21399 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACO1P21399 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACO1P21399 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACO1P21399 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACO1P21399 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACO1P21399 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACO1P21399 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ACO1P21399 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACO1P21399 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACO1P21399 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACO1P21399 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACO1P21399 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACO1P21399 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACO1P21399 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACO1P21399 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACO1P21399 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACO1P21399 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACO1P21399 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACO1P21399 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ACO1P21399 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACO1P21399 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACO1P21399 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACO1P21399 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACO1P21399 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACO1P21399 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACO1P21399 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACO1P21399 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACO1P21399 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACO1P21399 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACO1P21399 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACO1P21399 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACO1P21399 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACO1P21399 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACO1P21399 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACO1P21399 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACO1P21399 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACO1P21399 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACO1P21399 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACO1P21399 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACO1P21399 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACO1P21399 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACO1P21399 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACO1P21399 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACO1P21399 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACO1P21399 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACO1P21399 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACO1P21399 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACO1P21399 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACO1P21399 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACO1P21399 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACO1P21399 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACO1P21399 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACO1P21399 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACO1P21399 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACO1P21399 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACO1P21399 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACO1P21399 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACO1P21399 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACO1P21399 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACO1P21399 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACO1P21399 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACO1P21399 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACO1P21399 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACO1P21399 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACO1P21399 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACO1P21399 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACO1P21399 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACO1P21399 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACO1P21399 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACO1P21399 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACO1P21399 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACO1P21399 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACO1P21399 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACO1P21399 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACO1P21399 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACO1P21399 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACO1P21399 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACO1P21399 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACO1P21399 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACO1P21399 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACO1P21399 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACO1P21399 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACO1P21399 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACO1P21399 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACO1P21399 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACO1P21399 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACO1P21399 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms