Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD247P20963 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD247P20963 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD247P20963 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD247P20963 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD247P20963 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD247P20963 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD247P20963 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD247P20963 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD247P20963 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD247P20963 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD247P20963 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD247P20963 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD247P20963 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD247P20963 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD247P20963 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD247P20963 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD247P20963 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD247P20963 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD247P20963 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD247P20963 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD247P20963 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CD247P20963 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD247P20963 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD247P20963 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD247P20963 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD247P20963 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD247P20963 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD247P20963 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD247P20963 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD247P20963 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD247P20963 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD247P20963 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD247P20963 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD247P20963 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD247P20963 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD247P20963 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD247P20963 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD247P20963 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD247P20963 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD247P20963 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD247P20963 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD247P20963 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD247P20963 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD247P20963 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD247P20963 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD247P20963 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD247P20963 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD247P20963 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD247P20963 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD247P20963 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD247P20963 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD247P20963 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD247P20963 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD247P20963 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD247P20963 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD247P20963 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD247P20963 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD247P20963 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD247P20963 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD247P20963 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD247P20963 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD247P20963 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD247P20963 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD247P20963 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD247P20963 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD247P20963 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD247P20963 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD247P20963 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD247P20963 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD247P20963 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD247P20963 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CD247P20963 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CD247P20963 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CD247P20963 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CD247P20963 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD247P20963 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD247P20963 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD247P20963 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD247P20963 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD247P20963 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD247P20963 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD247P20963 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD247P20963 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD247P20963 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD247P20963 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD247P20963 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD247P20963 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD247P20963 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD247P20963 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD247P20963 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD247P20963 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CD247P20963 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD247P20963 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD247P20963 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD247P20963 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD247P20963 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD247P20963 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD247P20963 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD247P20963 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms