Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCP20941 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCP20941 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCP20941 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCP20941 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCP20941 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCP20941 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCP20941 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCP20941 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCP20941 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCP20941 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCP20941 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCP20941 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCP20941 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCP20941 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCP20941 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCP20941 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCP20941 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCP20941 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCP20941 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCP20941 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCP20941 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCP20941 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCP20941 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCP20941 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCP20941 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCP20941 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCP20941 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCP20941 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCP20941 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCP20941 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCP20941 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCP20941 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCP20941 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCP20941 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCP20941 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCP20941 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCP20941 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCP20941 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCP20941 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCP20941 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCP20941 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCP20941 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCP20941 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCP20941 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCP20941 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCP20941 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCP20941 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCP20941 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCP20941 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCP20941 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCP20941 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCP20941 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCP20941 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCP20941 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCP20941 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCP20941 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCP20941 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCP20941 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCP20941 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCP20941 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCP20941 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCP20941 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCP20941 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCP20941 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCP20941 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCP20941 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCP20941 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCP20941 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCP20941 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCP20941 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCP20941 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCP20941 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCP20941 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCP20941 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCP20941 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCP20941 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCP20941 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCP20941 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCP20941 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCP20941 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCP20941 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCP20941 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCP20941 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCP20941 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCP20941 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCP20941 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCP20941 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCP20941 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCP20941 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDCP20941 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDCP20941 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDCP20941 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCP20941 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCP20941 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCP20941 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCP20941 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCP20941 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCP20941 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCP20941 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms