Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD58P19256 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CD58P19256 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD58P19256 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD58P19256 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD58P19256 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD58P19256 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD58P19256 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD58P19256 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD58P19256 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CD58P19256 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD58P19256 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD58P19256 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD58P19256 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD58P19256 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD58P19256 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD58P19256 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD58P19256 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD58P19256 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD58P19256 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD58P19256 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD58P19256 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD58P19256 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD58P19256 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD58P19256 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD58P19256 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD58P19256 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD58P19256 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD58P19256 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD58P19256 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD58P19256 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD58P19256 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD58P19256 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD58P19256 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD58P19256 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD58P19256 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD58P19256 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD58P19256 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD58P19256 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD58P19256 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD58P19256 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD58P19256 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD58P19256 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD58P19256 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD58P19256 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD58P19256 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD58P19256 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD58P19256 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD58P19256 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD58P19256 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD58P19256 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD58P19256 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD58P19256 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CD58P19256 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD58P19256 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD58P19256 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD58P19256 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD58P19256 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD58P19256 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD58P19256 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD58P19256 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD58P19256 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD58P19256 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD58P19256 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD58P19256 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD58P19256 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD58P19256 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD58P19256 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD58P19256 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD58P19256 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD58P19256 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CD58P19256 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD58P19256 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD58P19256 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD58P19256 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD58P19256 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD58P19256 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CD58P19256 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD58P19256 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD58P19256 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD58P19256 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD58P19256 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CD58P19256 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CD58P19256 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CD58P19256 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD58P19256 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD58P19256 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD58P19256 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD58P19256 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD58P19256 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD58P19256 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD58P19256 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD58P19256 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD58P19256 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD58P19256 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD58P19256 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD58P19256 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD58P19256 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD58P19256 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD58P19256 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms