Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNNI1P19237 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI1P19237 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms