Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UCHL3P15374 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UCHL3P15374 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms