Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM27P14373 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms