Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-EP13747 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-EP13747 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-EP13747 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-EP13747 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-EP13747 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-EP13747 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-EP13747 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-EP13747 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-EP13747 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-EP13747 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-EP13747 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-EP13747 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-EP13747 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-EP13747 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms