Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT13P13646 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT13P13646 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT13P13646 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT13P13646 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT13P13646 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT13P13646 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT13P13646 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT13P13646 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT13P13646 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT13P13646 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT13P13646 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT13P13646 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT13P13646 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT13P13646 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT13P13646 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT13P13646 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT13P13646 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT13P13646 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT13P13646 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT13P13646 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT13P13646 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT13P13646 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT13P13646 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT13P13646 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT13P13646 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT13P13646 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT13P13646 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT13P13646 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT13P13646 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT13P13646 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT13P13646 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT13P13646 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT13P13646 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT13P13646 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT13P13646 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT13P13646 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT13P13646 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT13P13646 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT13P13646 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT13P13646 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT13P13646 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT13P13646 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT13P13646 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT13P13646 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT13P13646 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT13P13646 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT13P13646 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT13P13646 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT13P13646 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT13P13646 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT13P13646 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT13P13646 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT13P13646 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT13P13646 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT13P13646 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT13P13646 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT13P13646 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT13P13646 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT13P13646 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT13P13646 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT13P13646 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT13P13646 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT13P13646 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT13P13646 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT13P13646 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT13P13646 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT13P13646 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT13P13646 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT13P13646 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT13P13646 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT13P13646 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT13P13646 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT13P13646 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT13P13646 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT13P13646 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT13P13646 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT13P13646 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT13P13646 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT13P13646 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT13P13646 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT13P13646 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT13P13646 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT13P13646 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT13P13646 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT13P13646 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT13P13646 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT13P13646 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT13P13646 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT13P13646 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT13P13646 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT13P13646 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT13P13646 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT13P13646 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT13P13646 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT13P13646 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT13P13646 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT13P13646 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT13P13646 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT13P13646 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms