Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A3P13637 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP1A3P13637 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP1A3P13637 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP1A3P13637 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP1A3P13637 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP1A3P13637 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP1A3P13637 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP1A3P13637 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A3P13637 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A3P13637 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A3P13637 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A3P13637 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A3P13637 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A3P13637 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A3P13637 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A3P13637 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms