Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODC1P11926 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODC1P11926 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODC1P11926 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODC1P11926 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODC1P11926 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODC1P11926 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODC1P11926 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ODC1P11926 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODC1P11926 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ODC1P11926 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODC1P11926 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ODC1P11926 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ODC1P11926 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ODC1P11926 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODC1P11926 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODC1P11926 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODC1P11926 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODC1P11926 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODC1P11926 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODC1P11926 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODC1P11926 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODC1P11926 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODC1P11926 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODC1P11926 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODC1P11926 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODC1P11926 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODC1P11926 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODC1P11926 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODC1P11926 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODC1P11926 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODC1P11926 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODC1P11926 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODC1P11926 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODC1P11926 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODC1P11926 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODC1P11926 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODC1P11926 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODC1P11926 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODC1P11926 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODC1P11926 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODC1P11926 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODC1P11926 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODC1P11926 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODC1P11926 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODC1P11926 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ODC1P11926 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODC1P11926 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODC1P11926 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODC1P11926 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODC1P11926 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODC1P11926 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODC1P11926 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODC1P11926 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODC1P11926 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODC1P11926 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODC1P11926 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODC1P11926 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODC1P11926 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODC1P11926 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ODC1P11926 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODC1P11926 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODC1P11926 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODC1P11926 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODC1P11926 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODC1P11926 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODC1P11926 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODC1P11926 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODC1P11926 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODC1P11926 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODC1P11926 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODC1P11926 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODC1P11926 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODC1P11926 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODC1P11926 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODC1P11926 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ODC1P11926 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODC1P11926 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODC1P11926 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODC1P11926 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODC1P11926 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODC1P11926 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODC1P11926 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODC1P11926 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODC1P11926 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODC1P11926 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODC1P11926 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODC1P11926 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODC1P11926 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODC1P11926 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODC1P11926 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODC1P11926 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODC1P11926 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODC1P11926 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODC1P11926 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODC1P11926 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODC1P11926 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODC1P11926 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODC1P11926 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODC1P11926 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms