Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CETPP11597 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CETPP11597 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CETPP11597 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CETPP11597 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CETPP11597 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CETPP11597 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CETPP11597 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CETPP11597 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CETPP11597 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CETPP11597 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CETPP11597 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CETPP11597 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CETPP11597 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CETPP11597 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CETPP11597 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CETPP11597 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CETPP11597 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CETPP11597 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CETPP11597 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CETPP11597 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CETPP11597 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CETPP11597 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CETPP11597 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CETPP11597 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CETPP11597 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CETPP11597 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CETPP11597 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CETPP11597 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CETPP11597 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CETPP11597 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CETPP11597 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CETPP11597 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CETPP11597 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CETPP11597 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CETPP11597 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CETPP11597 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CETPP11597 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CETPP11597 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CETPP11597 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CETPP11597 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CETPP11597 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CETPP11597 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CETPP11597 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CETPP11597 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CETPP11597 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CETPP11597 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CETPP11597 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CETPP11597 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CETPP11597 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CETPP11597 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CETPP11597 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CETPP11597 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CETPP11597 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CETPP11597 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CETPP11597 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CETPP11597 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CETPP11597 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CETPP11597 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CETPP11597 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CETPP11597 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CETPP11597 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CETPP11597 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CETPP11597 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CETPP11597 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CETPP11597 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CETPP11597 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CETPP11597 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CETPP11597 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CETPP11597 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CETPP11597 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CETPP11597 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CETPP11597 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CETPP11597 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CETPP11597 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CETPP11597 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CETPP11597 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CETPP11597 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CETPP11597 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CETPP11597 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CETPP11597 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CETPP11597 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CETPP11597 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CETPP11597 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CETPP11597 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CETPP11597 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CETPP11597 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CETPP11597 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CETPP11597 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CETPP11597 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CETPP11597 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CETPP11597 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CETPP11597 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CETPP11597 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CETPP11597 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CETPP11597 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CETPP11597 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CETPP11597 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CETPP11597 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CETPP11597 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms