Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNB1P11230 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNB1P11230 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNB1P11230 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNB1P11230 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNB1P11230 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNB1P11230 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHRNB1P11230 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNB1P11230 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNB1P11230 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNB1P11230 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNB1P11230 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHRNB1P11230 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNB1P11230 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNB1P11230 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNB1P11230 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNB1P11230 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNB1P11230 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNB1P11230 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB1P11230 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB1P11230 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB1P11230 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB1P11230 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB1P11230 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB1P11230 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB1P11230 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB1P11230 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB1P11230 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB1P11230 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB1P11230 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB1P11230 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB1P11230 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB1P11230 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB1P11230 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB1P11230 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB1P11230 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB1P11230 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB1P11230 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB1P11230 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB1P11230 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB1P11230 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB1P11230 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB1P11230 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB1P11230 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB1P11230 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB1P11230 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB1P11230 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB1P11230 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB1P11230 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB1P11230 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB1P11230 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB1P11230 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB1P11230 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB1P11230 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB1P11230 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB1P11230 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB1P11230 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB1P11230 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB1P11230 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB1P11230 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB1P11230 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB1P11230 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB1P11230 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB1P11230 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB1P11230 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB1P11230 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB1P11230 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB1P11230 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB1P11230 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB1P11230 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.3 ms