Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX5BP10606 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX5BP10606 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX5BP10606 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX5BP10606 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX5BP10606 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX5BP10606 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX5BP10606 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX5BP10606 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX5BP10606 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COX5BP10606 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX5BP10606 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX5BP10606 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX5BP10606 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COX5BP10606 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COX5BP10606 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX5BP10606 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX5BP10606 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX5BP10606 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX5BP10606 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX5BP10606 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX5BP10606 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX5BP10606 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX5BP10606 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX5BP10606 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX5BP10606 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX5BP10606 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX5BP10606 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX5BP10606 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX5BP10606 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX5BP10606 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX5BP10606 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX5BP10606 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX5BP10606 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX5BP10606 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX5BP10606 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX5BP10606 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX5BP10606 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX5BP10606 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX5BP10606 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX5BP10606 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COX5BP10606 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX5BP10606 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX5BP10606 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX5BP10606 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX5BP10606 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COX5BP10606 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COX5BP10606 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COX5BP10606 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX5BP10606 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX5BP10606 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX5BP10606 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX5BP10606 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX5BP10606 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COX5BP10606 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX5BP10606 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX5BP10606 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX5BP10606 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX5BP10606 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX5BP10606 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX5BP10606 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX5BP10606 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX5BP10606 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX5BP10606 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX5BP10606 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX5BP10606 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX5BP10606 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COX5BP10606 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX5BP10606 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX5BP10606 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX5BP10606 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX5BP10606 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX5BP10606 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX5BP10606 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX5BP10606 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX5BP10606 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX5BP10606 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX5BP10606 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX5BP10606 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX5BP10606 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX5BP10606 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX5BP10606 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COX5BP10606 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX5BP10606 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COX5BP10606 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX5BP10606 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX5BP10606 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX5BP10606 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX5BP10606 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX5BP10606 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX5BP10606 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX5BP10606 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX5BP10606 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COX5BP10606 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COX5BP10606 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COX5BP10606 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COX5BP10606 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COX5BP10606 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COX5BP10606 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COX5BP10606 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms