Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAA2P0DJI9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms