Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD2P0DJD1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms