Protein–RNA interactions for Protein: P0CX38

RPS6B, 40S ribosomal protein S6-B, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS6BP0CX38 UTP11YKL099C 753 nt5.01□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 YLR346CYLR346C 306 nt5.01□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 SEC39YLR440C 2130 nt5.01□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 SHS1YDL225W 1656 nt5.01□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 NDC80YIL144W 2076 nt5□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 SDH7YDR511W 402 nt5□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 YJR111CYJR111C 852 nt5□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 PKR1YMR123W 369 nt5□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 SAP30YMR263W 606 nt5□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt5□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 YMR320WYMR320W 306 nt5□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 YTA6YPL074W 2265 nt5□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 THI7YLR237W 1797 nt4.99□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 IRC2YDR112W 309 nt4.99□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 YJR085CYJR085C 318 nt4.99□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 CDC33YOL139C 642 nt4.99□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 YOP1YPR028W 543 nt4.99□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 FRM2YCL026C-A 582 nt4.99□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 MCX1YBR227C 1563 nt4.99□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 SWI3YJL176C 2478 nt4.98□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 SNA2YDR525W-A 240 nt4.98□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 RTT105YER104W 627 nt4.98□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 GRX4YER174C 735 nt4.98□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 VPS29YHR012W 849 nt4.98□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 MBP1YDL056W 2502 nt4.98□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 IMA1YGR287C 1770 nt4.98□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 KAP114YGL241W 3015 nt4.98□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 YND1YER005W 1893 nt4.98□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 ATM1YMR301C 2073 nt4.97□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 ARN1YHL040C 1884 nt4.97□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt4.97□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 RPS24BYIL069C 408 nt4.97□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 MRPL39YML009C 213 nt4.97□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 ATP3YBR039W 936 nt4.97□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 PHO88YBR106W 567 nt4.97□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 HIR2YOR038C 2628 nt4.97□□□□□ -1.61
RPS6BP0CX38 CYK3YDL117W 2658 nt4.96□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 CBF5YLR175W 1452 nt4.96□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 HDA2YDR295C 2025 nt4.96□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.96□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 ICY1YMR195W 384 nt4.96□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 DNF2YDR093W 4839 nt4.96□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 YER158CYER158C 1722 nt4.95□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 VPS45YGL095C 1734 nt4.95□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 SYO1YDL063C 1863 nt4.95□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 ARF2YDL137W 546 nt4.95□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt4.95□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt4.95□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt4.95□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 VTI1YMR197C 654 nt4.95□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt4.95□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 SWP82YFL049W 1872 nt4.94□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 GPI17YDR434W 1605 nt4.94□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 KAR9YPL269W 1935 nt4.94□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 GRX2YDR513W 432 nt4.94□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 ECO1YFR027W 846 nt4.94□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 YAL037WYAL037W 804 nt4.94□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 PAM18YLR008C 507 nt4.94□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 YLR076CYLR076C 423 nt4.94□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 RMP1YLR145W 606 nt4.94□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 FBP1YLR377C 1047 nt4.94□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt4.94□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 ECM33YBR078W 1290 nt4.94□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 PXA1YPL147W 2613 nt4.94□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 POL4YCR014C 1749 nt4.94□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 GSM1YJL103C 1857 nt4.94□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 HPC2YBR215W 1878 nt4.94□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 PSE1YMR308C 3270 nt4.94□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 SAP4YGL229C 2457 nt4.94□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 PPZ1YML016C 2079 nt4.93□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 PEP7YDR323C 1548 nt4.93□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 PDR15YDR406W 4590 nt4.93□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 HUL5YGL141W 2733 nt4.93□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 YDL009CYDL009C 324 nt4.93□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 RPP1AYDL081C 321 nt4.93□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 YDR090CYDR090C 933 nt4.93□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 YER084WYER084W 387 nt4.93□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 SMX2YFL017W-A 234 nt4.93□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 MIC19YFR011C 513 nt4.93□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 COX4YGL187C 468 nt4.93□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 GPP1YIL053W 753 nt4.93□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 COA3YJL062W-A 258 nt4.93□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 SRS2YJL092W 3525 nt4.93□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 ERP4YOR016C 624 nt4.93□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 MDM36YPR083W 1740 nt4.93□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 TPA1YER049W 1935 nt4.93□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 STP2YHR006W 1626 nt4.93□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 SWC3YAL011W 1878 nt4.92□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 SCY1YGL083W 2415 nt4.92□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 ATH1YPR026W 3636 nt4.92□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 RIP1YEL024W 648 nt4.92□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 TCD1YHR003C 1290 nt4.92□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt4.92□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 YPT53YNL093W 663 nt4.92□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 RPC40YPR110C 1008 nt4.92□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 SEC9YGR009C 1956 nt4.92□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 MSC2YDR205W 2175 nt4.92□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 SIP1YDR422C 2448 nt4.92□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 OPI6YDL096C 327 nt4.91□□□□□ -1.62
RPS6BP0CX38 YHL026CYHL026C 948 nt4.91□□□□□ -1.62
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