Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTA3P0C7M3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms