Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEFMP07197 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEFMP07197 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEFMP07197 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEFMP07197 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NEFMP07197 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEFMP07197 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEFMP07197 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEFMP07197 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEFMP07197 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEFMP07197 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEFMP07197 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEFMP07197 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEFMP07197 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NEFMP07197 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEFMP07197 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NEFMP07197 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEFMP07197 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEFMP07197 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NEFMP07197 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NEFMP07197 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEFMP07197 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEFMP07197 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEFMP07197 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEFMP07197 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEFMP07197 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFMP07197 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFMP07197 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFMP07197 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFMP07197 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFMP07197 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFMP07197 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFMP07197 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFMP07197 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFMP07197 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFMP07197 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFMP07197 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFMP07197 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFMP07197 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFMP07197 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFMP07197 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFMP07197 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFMP07197 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFMP07197 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFMP07197 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFMP07197 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEFMP07197 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEFMP07197 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEFMP07197 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEFMP07197 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEFMP07197 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEFMP07197 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEFMP07197 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEFMP07197 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEFMP07197 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEFMP07197 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEFMP07197 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEFMP07197 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEFMP07197 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEFMP07197 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEFMP07197 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEFMP07197 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEFMP07197 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEFMP07197 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEFMP07197 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEFMP07197 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEFMP07197 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEFMP07197 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEFMP07197 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEFMP07197 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEFMP07197 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEFMP07197 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEFMP07197 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEFMP07197 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEFMP07197 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEFMP07197 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEFMP07197 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEFMP07197 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEFMP07197 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEFMP07197 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NEFMP07197 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEFMP07197 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEFMP07197 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEFMP07197 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEFMP07197 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEFMP07197 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEFMP07197 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFMP07197 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFMP07197 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFMP07197 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFMP07197 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFMP07197 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFMP07197 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFMP07197 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFMP07197 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFMP07197 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFMP07197 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFMP07197 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFMP07197 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFMP07197 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms