Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDN1P05305 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDN1P05305 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDN1P05305 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDN1P05305 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDN1P05305 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDN1P05305 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EDN1P05305 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDN1P05305 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDN1P05305 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDN1P05305 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDN1P05305 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDN1P05305 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDN1P05305 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDN1P05305 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDN1P05305 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EDN1P05305 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EDN1P05305 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDN1P05305 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDN1P05305 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDN1P05305 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDN1P05305 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDN1P05305 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDN1P05305 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDN1P05305 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDN1P05305 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDN1P05305 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDN1P05305 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EDN1P05305 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDN1P05305 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDN1P05305 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDN1P05305 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDN1P05305 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDN1P05305 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDN1P05305 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDN1P05305 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDN1P05305 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDN1P05305 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDN1P05305 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDN1P05305 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDN1P05305 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDN1P05305 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDN1P05305 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDN1P05305 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EDN1P05305 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EDN1P05305 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDN1P05305 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDN1P05305 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EDN1P05305 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EDN1P05305 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDN1P05305 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDN1P05305 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDN1P05305 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDN1P05305 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDN1P05305 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDN1P05305 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDN1P05305 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDN1P05305 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EDN1P05305 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EDN1P05305 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDN1P05305 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EDN1P05305 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDN1P05305 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDN1P05305 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDN1P05305 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EDN1P05305 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDN1P05305 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDN1P05305 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDN1P05305 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDN1P05305 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDN1P05305 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDN1P05305 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDN1P05305 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDN1P05305 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EDN1P05305 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EDN1P05305 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDN1P05305 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDN1P05305 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EDN1P05305 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EDN1P05305 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDN1P05305 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDN1P05305 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDN1P05305 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDN1P05305 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDN1P05305 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDN1P05305 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDN1P05305 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDN1P05305 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDN1P05305 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDN1P05305 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDN1P05305 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDN1P05305 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDN1P05305 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDN1P05305 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDN1P05305 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDN1P05305 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDN1P05305 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDN1P05305 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDN1P05305 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDN1P05305 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms