Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPTA1P02549 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTA1P02549 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms