Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DRAP01903 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRAP01903 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms