Protein–RNA interactions for Protein: P01730

CD4, T-cell surface glycoprotein CD4, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD4P01730 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CD4P01730 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD4P01730 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD4P01730 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD4P01730 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD4P01730 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD4P01730 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD4P01730 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD4P01730 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD4P01730 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD4P01730 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD4P01730 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD4P01730 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD4P01730 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD4P01730 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD4P01730 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD4P01730 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD4P01730 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD4P01730 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD4P01730 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD4P01730 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD4P01730 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD4P01730 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CD4P01730 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD4P01730 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD4P01730 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD4P01730 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD4P01730 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD4P01730 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD4P01730 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD4P01730 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD4P01730 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD4P01730 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD4P01730 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD4P01730 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD4P01730 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD4P01730 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD4P01730 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD4P01730 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD4P01730 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD4P01730 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD4P01730 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD4P01730 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD4P01730 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD4P01730 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD4P01730 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD4P01730 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD4P01730 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD4P01730 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CD4P01730 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD4P01730 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD4P01730 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CD4P01730 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD4P01730 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD4P01730 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD4P01730 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD4P01730 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD4P01730 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD4P01730 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD4P01730 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD4P01730 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD4P01730 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD4P01730 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD4P01730 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD4P01730 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD4P01730 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD4P01730 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD4P01730 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD4P01730 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD4P01730 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD4P01730 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD4P01730 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD4P01730 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD4P01730 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD4P01730 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD4P01730 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CD4P01730 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD4P01730 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD4P01730 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD4P01730 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD4P01730 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD4P01730 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD4P01730 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD4P01730 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CD4P01730 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD4P01730 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CD4P01730 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD4P01730 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD4P01730 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD4P01730 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD4P01730 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD4P01730 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD4P01730 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD4P01730 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD4P01730 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD4P01730 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD4P01730 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD4P01730 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD4P01730 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD4P01730 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms