Protein–RNA interactions for Protein: O95248

SBF1, Myotubularin-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBF1O95248 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SBF1O95248 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SBF1O95248 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SBF1O95248 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SBF1O95248 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SBF1O95248 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SBF1O95248 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SBF1O95248 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SBF1O95248 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SBF1O95248 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SBF1O95248 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SBF1O95248 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SBF1O95248 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SBF1O95248 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SBF1O95248 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SBF1O95248 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SBF1O95248 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SBF1O95248 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SBF1O95248 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SBF1O95248 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SBF1O95248 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SBF1O95248 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SBF1O95248 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SBF1O95248 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SBF1O95248 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SBF1O95248 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SBF1O95248 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SBF1O95248 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SBF1O95248 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SBF1O95248 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SBF1O95248 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SBF1O95248 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SBF1O95248 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SBF1O95248 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SBF1O95248 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SBF1O95248 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SBF1O95248 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SBF1O95248 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SBF1O95248 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SBF1O95248 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SBF1O95248 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SBF1O95248 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SBF1O95248 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SBF1O95248 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SBF1O95248 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SBF1O95248 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SBF1O95248 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SBF1O95248 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SBF1O95248 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SBF1O95248 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SBF1O95248 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SBF1O95248 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SBF1O95248 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SBF1O95248 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SBF1O95248 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SBF1O95248 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SBF1O95248 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SBF1O95248 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SBF1O95248 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SBF1O95248 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SBF1O95248 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SBF1O95248 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SBF1O95248 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SBF1O95248 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SBF1O95248 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SBF1O95248 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SBF1O95248 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SBF1O95248 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SBF1O95248 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SBF1O95248 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SBF1O95248 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SBF1O95248 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SBF1O95248 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SBF1O95248 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SBF1O95248 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SBF1O95248 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SBF1O95248 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SBF1O95248 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SBF1O95248 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SBF1O95248 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SBF1O95248 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SBF1O95248 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SBF1O95248 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SBF1O95248 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SBF1O95248 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SBF1O95248 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SBF1O95248 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SBF1O95248 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SBF1O95248 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SBF1O95248 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SBF1O95248 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SBF1O95248 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SBF1O95248 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SBF1O95248 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SBF1O95248 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SBF1O95248 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SBF1O95248 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SBF1O95248 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SBF1O95248 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SBF1O95248 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms