Protein–RNA interactions for Protein: O75762

TRPA1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPA1O75762 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPA1O75762 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPA1O75762 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPA1O75762 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPA1O75762 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPA1O75762 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPA1O75762 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPA1O75762 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPA1O75762 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPA1O75762 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPA1O75762 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPA1O75762 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPA1O75762 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPA1O75762 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPA1O75762 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPA1O75762 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPA1O75762 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPA1O75762 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPA1O75762 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPA1O75762 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPA1O75762 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms