Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBNO60934 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBNO60934 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBNO60934 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBNO60934 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBNO60934 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBNO60934 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBNO60934 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBNO60934 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBNO60934 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBNO60934 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NBNO60934 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NBNO60934 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NBNO60934 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NBNO60934 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBNO60934 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBNO60934 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBNO60934 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBNO60934 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBNO60934 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBNO60934 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBNO60934 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBNO60934 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBNO60934 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBNO60934 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBNO60934 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBNO60934 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBNO60934 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBNO60934 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBNO60934 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBNO60934 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBNO60934 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBNO60934 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBNO60934 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBNO60934 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBNO60934 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBNO60934 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBNO60934 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBNO60934 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBNO60934 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBNO60934 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NBNO60934 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBNO60934 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBNO60934 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBNO60934 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBNO60934 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBNO60934 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBNO60934 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBNO60934 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBNO60934 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBNO60934 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBNO60934 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBNO60934 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NBNO60934 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBNO60934 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NBNO60934 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBNO60934 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBNO60934 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBNO60934 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBNO60934 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBNO60934 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBNO60934 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBNO60934 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBNO60934 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NBNO60934 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBNO60934 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NBNO60934 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBNO60934 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBNO60934 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBNO60934 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBNO60934 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBNO60934 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBNO60934 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBNO60934 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NBNO60934 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBNO60934 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBNO60934 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBNO60934 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NBNO60934 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBNO60934 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBNO60934 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBNO60934 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBNO60934 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBNO60934 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBNO60934 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBNO60934 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBNO60934 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBNO60934 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBNO60934 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBNO60934 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBNO60934 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBNO60934 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBNO60934 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBNO60934 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NBNO60934 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBNO60934 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBNO60934 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBNO60934 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBNO60934 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBNO60934 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms