Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8B3O60423 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8B3O60423 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8B3O60423 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8B3O60423 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8B3O60423 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP8B3O60423 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP8B3O60423 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP8B3O60423 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP8B3O60423 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP8B3O60423 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP8B3O60423 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP8B3O60423 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP8B3O60423 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP8B3O60423 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms