Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms