Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATCO43716 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATCO43716 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATCO43716 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATCO43716 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATCO43716 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATCO43716 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATCO43716 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATCO43716 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATCO43716 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GATCO43716 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GATCO43716 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GATCO43716 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GATCO43716 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GATCO43716 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GATCO43716 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GATCO43716 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GATCO43716 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GATCO43716 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GATCO43716 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GATCO43716 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GATCO43716 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GATCO43716 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GATCO43716 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GATCO43716 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GATCO43716 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GATCO43716 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GATCO43716 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GATCO43716 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GATCO43716 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GATCO43716 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GATCO43716 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GATCO43716 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GATCO43716 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GATCO43716 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GATCO43716 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GATCO43716 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GATCO43716 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GATCO43716 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GATCO43716 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GATCO43716 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GATCO43716 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GATCO43716 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GATCO43716 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GATCO43716 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GATCO43716 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GATCO43716 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GATCO43716 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GATCO43716 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GATCO43716 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GATCO43716 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GATCO43716 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GATCO43716 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATCO43716 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms