Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSTPIP1O43586 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSTPIP1O43586 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms