Protein–RNA interactions for Protein: O43491

EPB41L2, Band 4.1-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,005 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L2O43491 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41L2O43491 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L2O43491 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms