Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
COCHO43405 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
COCHO43405 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COCHO43405 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COCHO43405 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COCHO43405 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COCHO43405 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COCHO43405 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COCHO43405 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COCHO43405 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COCHO43405 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COCHO43405 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COCHO43405 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COCHO43405 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COCHO43405 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COCHO43405 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COCHO43405 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COCHO43405 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COCHO43405 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COCHO43405 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COCHO43405 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COCHO43405 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COCHO43405 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COCHO43405 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COCHO43405 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COCHO43405 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COCHO43405 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COCHO43405 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COCHO43405 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COCHO43405 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COCHO43405 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COCHO43405 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COCHO43405 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COCHO43405 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COCHO43405 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COCHO43405 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COCHO43405 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COCHO43405 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COCHO43405 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COCHO43405 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COCHO43405 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COCHO43405 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COCHO43405 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COCHO43405 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COCHO43405 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COCHO43405 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COCHO43405 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COCHO43405 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COCHO43405 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COCHO43405 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COCHO43405 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COCHO43405 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COCHO43405 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COCHO43405 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COCHO43405 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COCHO43405 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COCHO43405 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COCHO43405 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COCHO43405 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COCHO43405 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COCHO43405 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COCHO43405 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COCHO43405 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COCHO43405 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COCHO43405 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COCHO43405 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COCHO43405 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COCHO43405 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COCHO43405 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COCHO43405 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COCHO43405 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
COCHO43405 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COCHO43405 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COCHO43405 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COCHO43405 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COCHO43405 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COCHO43405 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COCHO43405 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COCHO43405 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COCHO43405 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COCHO43405 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COCHO43405 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COCHO43405 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COCHO43405 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COCHO43405 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COCHO43405 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COCHO43405 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
COCHO43405 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
COCHO43405 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
COCHO43405 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COCHO43405 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COCHO43405 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COCHO43405 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COCHO43405 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COCHO43405 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COCHO43405 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COCHO43405 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
COCHO43405 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
COCHO43405 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COCHO43405 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms