Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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HOXA3O43365 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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HOXA3O43365 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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HOXA3O43365 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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HOXA3O43365 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA3O43365 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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