Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATMINO43313 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATMINO43313 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATMINO43313 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATMINO43313 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATMINO43313 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATMINO43313 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATMINO43313 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMINO43313 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMINO43313 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMINO43313 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMINO43313 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMINO43313 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMINO43313 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMINO43313 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMINO43313 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMINO43313 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMINO43313 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMINO43313 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMINO43313 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMINO43313 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMINO43313 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMINO43313 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMINO43313 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMINO43313 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMINO43313 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMINO43313 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMINO43313 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMINO43313 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMINO43313 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMINO43313 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMINO43313 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATMINO43313 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATMINO43313 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATMINO43313 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATMINO43313 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATMINO43313 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATMINO43313 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATMINO43313 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATMINO43313 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATMINO43313 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATMINO43313 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATMINO43313 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATMINO43313 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATMINO43313 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATMINO43313 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATMINO43313 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATMINO43313 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATMINO43313 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATMINO43313 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATMINO43313 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATMINO43313 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATMINO43313 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATMINO43313 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATMINO43313 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATMINO43313 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATMINO43313 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATMINO43313 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATMINO43313 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATMINO43313 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATMINO43313 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATMINO43313 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATMINO43313 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATMINO43313 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATMINO43313 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATMINO43313 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATMINO43313 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATMINO43313 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATMINO43313 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATMINO43313 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATMINO43313 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATMINO43313 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATMINO43313 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATMINO43313 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATMINO43313 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATMINO43313 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATMINO43313 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATMINO43313 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATMINO43313 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATMINO43313 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATMINO43313 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATMINO43313 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATMINO43313 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATMINO43313 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATMINO43313 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATMINO43313 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATMINO43313 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATMINO43313 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATMINO43313 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATMINO43313 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATMINO43313 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATMINO43313 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATMINO43313 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATMINO43313 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATMINO43313 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATMINO43313 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATMINO43313 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATMINO43313 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATMINO43313 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATMINO43313 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms