Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTIFO43310 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTIFO43310 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTIFO43310 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTIFO43310 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTIFO43310 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTIFO43310 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTIFO43310 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTIFO43310 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTIFO43310 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTIFO43310 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTIFO43310 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTIFO43310 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTIFO43310 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTIFO43310 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTIFO43310 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTIFO43310 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTIFO43310 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTIFO43310 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTIFO43310 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTIFO43310 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTIFO43310 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTIFO43310 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTIFO43310 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTIFO43310 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTIFO43310 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTIFO43310 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTIFO43310 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTIFO43310 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTIFO43310 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTIFO43310 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTIFO43310 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTIFO43310 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTIFO43310 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTIFO43310 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTIFO43310 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTIFO43310 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTIFO43310 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTIFO43310 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTIFO43310 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTIFO43310 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTIFO43310 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTIFO43310 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTIFO43310 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTIFO43310 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTIFO43310 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTIFO43310 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTIFO43310 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTIFO43310 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTIFO43310 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTIFO43310 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTIFO43310 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTIFO43310 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTIFO43310 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTIFO43310 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTIFO43310 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTIFO43310 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTIFO43310 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTIFO43310 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTIFO43310 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTIFO43310 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTIFO43310 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTIFO43310 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTIFO43310 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTIFO43310 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTIFO43310 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTIFO43310 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTIFO43310 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTIFO43310 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTIFO43310 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTIFO43310 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTIFO43310 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTIFO43310 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTIFO43310 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTIFO43310 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTIFO43310 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTIFO43310 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTIFO43310 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTIFO43310 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTIFO43310 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTIFO43310 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTIFO43310 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTIFO43310 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTIFO43310 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTIFO43310 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTIFO43310 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTIFO43310 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTIFO43310 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTIFO43310 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTIFO43310 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTIFO43310 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTIFO43310 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTIFO43310 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTIFO43310 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTIFO43310 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTIFO43310 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTIFO43310 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTIFO43310 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTIFO43310 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTIFO43310 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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