Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC7A4O43246 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC7A4O43246 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC7A4O43246 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC7A4O43246 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC7A4O43246 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC7A4O43246 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC7A4O43246 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC7A4O43246 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC7A4O43246 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC7A4O43246 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC7A4O43246 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC7A4O43246 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC7A4O43246 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC7A4O43246 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC7A4O43246 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC7A4O43246 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC7A4O43246 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC7A4O43246 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC7A4O43246 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC7A4O43246 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC7A4O43246 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A4O43246 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A4O43246 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A4O43246 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A4O43246 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A4O43246 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A4O43246 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A4O43246 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A4O43246 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A4O43246 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A4O43246 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A4O43246 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A4O43246 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A4O43246 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A4O43246 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC7A4O43246 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A4O43246 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A4O43246 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A4O43246 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A4O43246 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A4O43246 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A4O43246 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A4O43246 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A4O43246 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A4O43246 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A4O43246 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A4O43246 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A4O43246 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A4O43246 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A4O43246 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A4O43246 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A4O43246 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC7A4O43246 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A4O43246 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A4O43246 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A4O43246 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A4O43246 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A4O43246 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A4O43246 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A4O43246 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC7A4O43246 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms