Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEFVO15553 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEFVO15553 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEFVO15553 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEFVO15553 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MEFVO15553 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEFVO15553 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEFVO15553 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEFVO15553 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEFVO15553 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEFVO15553 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEFVO15553 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEFVO15553 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEFVO15553 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEFVO15553 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEFVO15553 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEFVO15553 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEFVO15553 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEFVO15553 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEFVO15553 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEFVO15553 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MEFVO15553 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEFVO15553 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEFVO15553 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEFVO15553 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEFVO15553 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEFVO15553 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEFVO15553 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEFVO15553 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEFVO15553 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEFVO15553 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEFVO15553 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEFVO15553 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEFVO15553 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEFVO15553 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEFVO15553 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MEFVO15553 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEFVO15553 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEFVO15553 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEFVO15553 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEFVO15553 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEFVO15553 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEFVO15553 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEFVO15553 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEFVO15553 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEFVO15553 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEFVO15553 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEFVO15553 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEFVO15553 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEFVO15553 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEFVO15553 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEFVO15553 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MEFVO15553 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEFVO15553 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEFVO15553 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEFVO15553 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEFVO15553 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEFVO15553 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEFVO15553 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEFVO15553 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MEFVO15553 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MEFVO15553 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MEFVO15553 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MEFVO15553 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MEFVO15553 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MEFVO15553 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEFVO15553 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEFVO15553 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEFVO15553 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEFVO15553 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MEFVO15553 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEFVO15553 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEFVO15553 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEFVO15553 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEFVO15553 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEFVO15553 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEFVO15553 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEFVO15553 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEFVO15553 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEFVO15553 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEFVO15553 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MEFVO15553 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEFVO15553 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEFVO15553 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEFVO15553 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEFVO15553 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEFVO15553 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEFVO15553 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEFVO15553 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEFVO15553 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEFVO15553 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MEFVO15553 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEFVO15553 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEFVO15553 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEFVO15553 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEFVO15553 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEFVO15553 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEFVO15553 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MEFVO15553 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEFVO15553 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms