Protein–RNA interactions for Protein: O14576

DYNC1I1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I1O14576 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DYNC1I1O14576 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1I1O14576 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms