Protein–RNA interactions for Protein: O00522

KRIT1, Krev interaction trapped protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRIT1O00522 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRIT1O00522 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms