Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3C2AO00443 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3C2AO00443 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms