Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3KR12 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
J3KR12 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
J3KR12 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3KR12 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3KR12 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3KR12 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3KR12 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3KR12 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3KR12 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3KR12 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3KR12 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3KR12 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3KR12 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3KR12 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3KR12 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3KR12 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3KR12 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3KR12 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3KR12 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3KR12 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3KR12 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3KR12 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3KR12 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3KR12 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3KR12 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3KR12 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3KR12 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
J3KR12 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KR12 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KR12 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KR12 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KR12 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KR12 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KR12 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KR12 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KR12 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KR12 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KR12 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KR12 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KR12 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KR12 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KR12 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KR12 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KR12 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KR12 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KR12 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KR12 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KR12 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KR12 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KR12 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KR12 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KR12 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KR12 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KR12 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KR12 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KR12 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KR12 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KR12 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KR12 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KR12 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KR12 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KR12 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KR12 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KR12 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KR12 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KR12 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KR12 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KR12 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KR12 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KR12 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KR12 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KR12 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KR12 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3KR12 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3KR12 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3KR12 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3KR12 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3KR12 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3KR12 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3KR12 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3KR12 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3KR12 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3KR12 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3KR12 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3KR12 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3KR12 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3KR12 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3KR12 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3KR12 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3KR12 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3KR12 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3KR12 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3KR12 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3KR12 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3KR12 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3KR12 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3KR12 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3KR12 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3KR12 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms