Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NACAE9PAV3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NACAE9PAV3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms