Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HHLA1C9JL84 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HHLA1C9JL84 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms