Protein–RNA interactions for Protein: C9JCN9

HSBP1L1, Heat shock factor-binding protein 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSBP1L1C9JCN9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSBP1L1C9JCN9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms