Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRRM5B3KS81 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms