Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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LINC00587B1AMM8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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LINC00587B1AMM8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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LINC00587B1AMM8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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LINC00587B1AMM8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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LINC00587B1AMM8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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LINC00587B1AMM8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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LINC00587B1AMM8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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LINC00587B1AMM8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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LINC00587B1AMM8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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LINC00587B1AMM8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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LINC00587B1AMM8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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