Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms