Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NOTOA8MTQ0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms