Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms